Ciao Mapo,
è sempre bene controllare prima quanto sottoscritto nella convenzione di stage, che comunque fa fede al di là della normativa vigente, perché potrebbero essere state inserite alcune limitazioni come magari un minimo di presenze per considerare valido lo stage. In linea di massima però al rimborso dovresti avere diritto in ogni caso, essendo l'indennità di stage concepita proprio come copertura dei giorni di effettiva presenza in azienda.
Hai provato a chiedere anche all'ufficio paghe oppure all'ente promotore?
Facci sapere come andrà a finire, e un caro saluto